8 просмотров
Рейтинг статьи
1 звезда2 звезды3 звезды4 звезды5 звезд
Загрузка...

Сдать анализ на амф дезаминаза ampd1 выявление мутации c34t

Мутации гена AMPD1 связаны с ожирением и диабетом у польских пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями

Предыдущие исследования показали связь общего функционального полиморфизма (C34T, Gln12Stop) в гене аденозинмонофосфат-деаминазы-1 (AMPD1) с выживаемостью при сердечной недостаточности (HF) и / или заболевании коронарной артерии (CAD). Целью исследования было поиск других мутаций в выбранных областях гена AMPD1 у польских пациентов с ИБС и HF, а также анализ их ассоциаций с ожирением и диабетом. Экзоны 2, 3, 5 и 7 из AMPD1 были сканированы на мутации у 97 пациентов с САПР без HF (CAD + HF-), 104 пациента с HF (HF +) и 200 новорожденных из Северо-Западной Польши с использованием денатурирующей высокоэффективной жидкости хроматография (DHPLC), полиморфизм длин рестрикционных фрагментов полимеразной цепной реакции (ПЦР-RFLP) и прямое секвенирование. Частоты мутации AMPD1 C34T, а также новые изменения последовательности A99G, G512A, IVS4-6delT и C784T были одинаковыми в трех группах, но мутантный аллель 860T был менее частым в комбинированных группах САПР + HF- и HF +, чем в контрольных (1,7% против 4,3%, p = 0,040). Гетерозиготный генотип 34CT ассоциировался с более низким (отношение шансов [OR] = 0,32, доверительный интервал 95% [CI] = 0,13-0,81) и 860AT с более высокой (OR = 13,7, 95% CI = 1,6-118) распространенностью диабета или гипергликемии в отношении гомозигот дикого типа. Абдоминальное ожирение было более частым у 860AT пациентов, чем у гомозигот дикого типа и 34CT гетерозигот (86% против 40% против 29%, p 0,05) не наблюдались для генотипов AMPD1 в двух исследовательских группах и в контроле (табл. 2). Мутированный аллель 860T был менее частым в обеих исследовательских группах, чем в контроле, а разница между объединенной группой САПР + HF- и HF + (n = 201) и новорожденными достигла статистической значимости (1,7 против 4,3%, p = 0,040). Никаких других существенных различий в генотипе AMPD1 и частотах аллелей не было обнаружено между этими тремя группами.
Таблица 2 Частотное распределение изменений последовательности AMPD1 у пациентов с ишемической болезнью сердца без сердечной недостаточности (CAD + HF-, n = 97), пациентов с сердечной недостаточностью (HF +, n = 104), контроля новорожденных (n = 200) и всех комбинированных групп (п = 401)

a Для всех частот генотипа в трех группах

b95% доверительный интервал для незначительной частоты аллелей

Для частот аллелей в трех группах

dExact-тест для отклонения частот генотипа от равновесия Харди-Вайнберга

Из-за неравновесности сцепления Т-аллель в локусе 34 почти всегда сопровождался аллелем Т в локусе 143, за исключением двух субъектов с генотипом 34CC-143CT. Были два субъекта с генотипом 34CT-143CT и сопутствующей заменой G512A и один с комбинацией 34CT-143CT-860AT. Все остальные аллели 512A и 860T были обнаружены у гомозигот 34CC-143CC.

Три новых варианта были найдены и подтверждены прямым секвенированием. Синонимичная замена A99G (Gly33Gly) в экзоне 3 была обнаружена у двух новорожденных (частота аллелей 99G: 0,25%, 95% ДИ: 0,03-0,9%). Он был добавлен в dbSNP недавно как rs61752480. Исключение IVS4-6delT в интроне 4, что приводит к усечению Т-тракта, расположенного непосредственно перед началом экзона 5 от 12T до 11T, было обнаружено в одном аллеле новорожденного (частота аллелей IVS4-6delT: 0,12%, 95% CI: 0,003-0,7%). Замещение C784T (Arg262Trp) в экзоне 7 было обнаружено в одном аллеле САПР + HF-пациента (частота аллелей 784T: 0,12%, 95% ДИ: 0,003-0,7%).

Гаплотипы, состоящие из семи полиморфных сайтов, оцененные с использованием алгоритма максимизации ожиданий, показаны в таблице 3. Никаких существенных различий в распределении гаплотипов AMPD1 между группами. Частота основного гаплотипа составляла 79,1% в комбинированных группах (n = 401). Гаплотип, несущий 34Т-аллель, имел частоту 16,2%, а остальные гаплотипы составляли 4,7%.
Таблица 3 Частотное распределение гаплотипов, включающих изменения последовательности генов C34T, A99G, C143T, IVS4-6delT, G512A, C784T и A860T AMPD1 у пациентов с ишемической болезнью сердца без сердечной недостаточности (CAD + HF-, n = 97), пациентов с сердечной недостаточностью ( HF +, n = 104) и новорожденных (n = 200).

Читать еще:  Сдать анализ на аллерген f242 вишня igg

Аллелы, отличные от дикого типа, выделены жирным шрифтом

p = 0,34, критерий Хи-квадрат для всех частот гаплотипов в трех группах

АМФ — дезаминаза (AMPD1). Выявление мутации C34T

Стоимость: 720 руб.

Маркер связан с особенностями развития скелетных мышц. Исследуется для выявления способности переносить продолжительные физические нагрузки.

Забота о здоровье будущего малыша – одна из основных задач каждой женщины. Поэтому так важно позаботится о предотвращении угроз его здоровью уже на самых ранних стадиях беременности.
Генетический анализ при беременности – необходимая процедура, на которую направит любой опытный врач. В условиях неблагоприятного климата всё возрастают шансы появления врождённых патологий у малышей. Кроме того генетический анализ обязательно показан женщинам старше 35 лет, семьям в которых уже были случаи рождения детей с генетическими патологиями и мам с вредными привычками, такими как алкоголь или курение. Наши специалисты будут рады видеть Вас, проведут точный анализ и необходимые консультации.
В нашем центре Вы сможете пройти генетический анализ на отцовство – наиболее достоверный из существующих методов установления родства между ребёнком и его биологическим отцом.
Мы будем рады вдеть Вас в нашем центре!

АМФ-дезаминаза (AMPD1). Выявление мутации C34T

Маркер связан с особенностями развития скелетных мышц. Исследуется для выявления способности переносить продолжительные физические нагрузки.

Полиморфизм длин рестрикционных фрагментов.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Венозную кровь, буккальный (щечный) эпителий.

Как правильно подготовиться к исследованию?

Специальной подготовки не требуется.

Локализация гена на хромосоме 1p13.2

Ген AMPD1 кодирует аденозинмонофосфат-дезаминазу 1, специфичный для скелетных мышц белок, участвующий в регуляции энергетических процессов. Он катализирует дезаминирование аденозин монофосфата (АМР, англ. аdenosine monophosphate) до инозина монофосфата (IMP, англ. inosine monophosphate) и играет важную роль в цикле пуриновых нуклеотидов.

Генетический маркер C34T

Участок ДНК в составе гена AMPD1, в котором происходит замена цитозина (С) на тимин (Т) в позиции 34, называется генетическим маркером C34T. Если в данной позиции находится цитозин, такой вариант гена обозначается как С-аллель, а если тимин – Т-аллель.

В результате данной замены кодон, кодирующий аминокислоту глутамин, замещается на стоп-кодон и синтез белка на нем прекращается. Синтезируется укороченный белок, лишенный каталитической активности.

Встречаемость в популяции

Встречаемость аллеля Т в европейской популяции составляет 11 %.

Общая информация об исследовании

В регуляции энергетического обмена в живых организмах принимает участие фермент – аденозинмонофосфат-дезаминаза (АМФ-дезаминаза). У человека существует 3 изоформы АМФ-дезаминаз: ген AMPD1 кодирует M (muscle, мышечную) изоформу, ген AMPD2 кодирует L (liver, печеночную) изоформу и ген AMPD3 кодирует E (erythrocyte, эритроцитарную) изоформу белка АМФ-дезаминазы.

Ген AMPD1 кодирует аденозинмонофосфат-дезаминазу 1, специфичый для скелетных мышц белок, участвующий в регуляции энергетических процессов. Он катализирует дезаминирование аденозин монофосфата (АМР, англ. аdenosine monophosphate) до инозина монофосфата (IMP, англ. inosine monophosphate) и играет важную роль в цикле пуриновых нуклеотидов.

Читать еще:  Сдать анализ на cytomegalovirus предранний белок iea igm igg

Специфическая для скелетных мышц изоформа АМФ-дезаминазы активируется при выполнении краткосрочных физических упражнений высокой интенсивности и является важным регулятором метаболизма мышечной энергии при физической нагрузке.

Сравнивая две группы людей, исследователи выявили, что частота генотипа Т/Т и аллеля Т ниже в группе спортсменов скоростно-силовых видов спорта, по сравнению с группой людей, не занимающихся спортом. Это говорит о том, что при становлении спортивного мастерства у атлетов происходит естественный отбор, который дает преимущества людям с благоприятными для спортивных достижений вариантами генов. Таким образом, аллель С гена AMPD1 можно считать маркером предрасположенности к скоростно-силовым видам мышечной деятельности. В то время как наличие в генотипе аллеля Т негативно сказывается на самочувствии человека при тяжелых физических нагрузках (может отмечаться слабость, быстрая утомляемость и мышечные судороги).

С другой стороны, была показана ассоциация наличия Т — аллеля в генотипе больных с ишемической болезнью сердца и сердечной недостаточностью и более редкой встречаемостью у них ожирения и диабета. То есть носительство генотипа С/Т или Т/Т является защитой от развития ожирения и диабета у таких пациентов. Аллель Т также ассоциирован с лучшей выживаемостью пациентов с ишемической болезнью сердца. Это связано с повышением концентрации аденозина в сердечной мышце, что защищает ее во время ишемических событий и продляет пациенту жизнь.

  • С/С – каталитическая активность АМФ-дезаминазы 1 не нарушена
  • С/Т — каталитическая активность АМФ-дезаминазы 1 снижена
  • Т/Т — каталитическая активность АМФ-дезаминазы 1 отсутствует

Результаты исследования должны интерпретироваться врачом в комплексе с другими генетическими, анамнестическими, клиническими и лабораторными данными.

Для данного маркера не существует понятия «норма» и «патология», т.к. исследуется полиморфизм гена.

Литература

  • Fedotovskaya ON, Danilova AA, Akhmetov II. Effect of AMPD1 gene polymorphism on muscle activity in humans. Bull Exp Biol Med. 2013 Feb;154(4):489-91. [PMID: 23486588]
  • Krzysztof Safranow et al. AMPD1 gene mutations are associated with obesity and diabetes in Polish patients with cardiovascular diseases. J Appl Genet. 2011 February; 52(1): 67–76. [PMID: 21108053]
  • Anderson JL, Habashi J, Carlquist JF, Muhlestein JB, Horne BD, Bair TL, Pearson RR, Hart N. A common variant ofthe AMPD1 gene predicts improved cardiovascular survival in patients with coronary artery disease. J Am Coll Cardiol. 2000 Oct;36(4):1248-52. [PMID: 11028479]

АМФ-дезаминаза (AMPD1). Выявление мутации C34T

Маркер связан с особенностями развития скелетных мышц. Исследуется для выявления способности переносить продолжительные физические нагрузки.

Локализация гена на хромосоме 1p13.2

Ген AMPD1 кодирует аденозинмонофосфат-дезаминазу 1, специфичный для скелетных мышц белок, участвующий в регуляции энергетических процессов. Он катализирует дезаминирование аденозин монофосфата (АМР, англ. аdenosine monophosphate) до инозина монофосфата (IMP, англ. inosine monophosphate) и играет важную роль в цикле пуриновых нуклеотидов.

Генетический маркер C34T

Участок ДНК в составе гена AMPD1, в котором происходит замена цитозина (С) на тимин (Т) в позиции 34, называется генетическим маркером C34T. Если в данной позиции находится цитозин, такой вариант гена обозначается как С-аллель, а если тимин – Т-аллель.

В результате данной замены кодон, кодирующий аминокислоту глутамин, замещается на стоп-кодон и синтез белка на нем прекращается. Синтезируется укороченный белок, лишенный каталитической активности.

Возможные генотипы

Частота встречаемости в популяции

Частота встречаемости аллеля Т в европейской популяции составляет 11 %.

В регуляции энергетического обмена в живых организмах принимает участие фермент – аденозинмонофосфат-дезаминаза (АМФ-дезаминаза). У человека существует 3 изоформы АМФ-дезаминаз: ген AMPD1 кодирует M (muscle, мышечную) изоформу, ген AMPD2 кодирует L (liver, печеночную) изоформу и ген AMPD3 кодирует E (erythrocyte, эритроцитарную) изоформу белка АМФ-дезаминазы.

Читать еще:  Сдать анализ на антистрептолизин о

Ген AMPD1 кодирует аденозинмонофосфат-дезаминазу 1, специфичый для скелетных мышц белок, участвующий в регуляции энергетических процессов. Он катализирует дезаминирование аденозин монофосфата (АМР, англ. аdenosine monophosphate) до инозина монофосфата (IMP, англ. inosine monophosphate) и играет важную роль в цикле пуриновых нуклеотидов.

Участок ДНК в составе гена AMPD1, в котором происходит замена цитозина (С) на тимин (Т) в позиции 34, называется генетическим маркером C34T. Если в данной позиции находится цитозин, такой вариант гена обозначается как С-аллель, а если тимин – Т-аллель.

В результате данной замены кодон, кодирующий аминокислоту глутамин, замещается на стоп-кодон и синтез белка на нем прекращается. Синтезируется укороченный белок, лишенный каталитической активности.

Специфическая для скелетных мышц изоформа АМФ-дезаминазы активируется при выполнении краткосрочных физических упражнений высокой интенсивности и является важным регулятором метаболизма мышечной энергии при физической нагрузке.

Сравнивая две группы людей, исследователи выявили, что частота генотипа Т/Т и аллеля Т ниже в группе спортсменов скоростно-силовых видов спорта, по сравнению с группой людей, не занимающихся спортом. Это говорит о том, что при становлении спортивного мастерства у атлетов происходит естественный отбор, который дает преимущества спортсменам с благоприятными для спортивных достижений вариантами генов. Таким образом, аллель С гена AMPD1 можно считать маркером предрасположенности к скоростно-силовым видам мышечной деятельности. В то время как наличие в генотипе аллеля Т негативно сказывается на самочувствии человека при тяжелых физических нагрузках (может отмечаться слабость, быстрая утомляемость и мышечные судороги).

С другой стороны, была показана ассоциация наличия Т — аллеля в генотипе больных с ишемической болезнью сердца и сердечной недостаточностью и более редкой встречаемостью у них ожирения и диабета. То есть носительство генотипа С/Т или Т/Т является защитой от развития ожирения и диабета у таких пациентов. Аллель Т также ассоциирован с лучшей выживаемостью пациентов с ишемической болезнью сердца. Это связано с повышением концентрации аденозина в сердечной мышце, что защищает её во время ишемических событий и продляет пациенту жизнь.

  • С/С – каталитическая активность АМФ-дезаминазы 1 не нарушена
  • С/Т — каталитическая активность АМФ-дезаминазы 1 снижена
  • Т/Т — каталитическая активность АМФ-дезаминазы 1 отсутствует

Результаты исследования должны интерпретироваться врачом в комплексе с другими генетическими, анамнестическими, клиническими и лабораторными данными.

Для данного маркера не существует понятия «норма» и «патология», т.к. исследуется полиморфизм гена.

Литература

  • Fedotovskaya ON, Danilova AA, Akhmetov II. Effect of AMPD1 gene polymorphism on muscle activity in humans. Bull Exp Biol Med. 2013 Feb;154(4):489-91. [PMID: 23486588]
  • Krzysztof Safranow et al. AMPD1 gene mutations are associated with obesity and diabetes in Polish patients with cardiovascular diseases. J Appl Genet. 2011 February; 52(1): 67–76. [PMID: 21108053]
  • Anderson JL, Habashi J, Carlquist JF, Muhlestein JB, Horne BD, Bair TL, Pearson RR, Hart N. A common variant ofthe AMPD1 gene predicts improved cardiovascular survival in patients with coronary artery disease. J Am Coll Cardiol. 2000 Oct;36(4):1248-52. [PMID: 11028479]
Подписка на новости

Оставьте ваш E-mail и получайте новости, а также эксклюзивные предложения от лаборатории KDLmed

голоса
Рейтинг статьи
Ссылка на основную публикацию
Adblock
detector